BAliBASE 2

mail to   Julie Thompson    or    Raymond Ripp

download BAliBASE2      see also BAliBASE3

ref6/test/ank_ref6
     test/ank_ref6_centre
          ank_ref6_schema
          apo_ref6
          apo_ref6_centre
          apo_ref6_schema
          dead_ref6
          dead_ref6_centre
          dead_ref6_schema
          faa_ref6
          faa_ref6_centre
          faa_ref6_schema
          ion_ref6
          ion_ref6_centre
          ion_ref6_schema
          kringle_ref6
          kringle_ref6_centre
          kringle_ref6_schema
          ktn+trk_ref6
          ktn+trk_ref6_centre
          ktn+trk_ref6_schema
          lrr_ref6
          lrr_ref6_centre
          lrr_ref6_schema
          myb_ref6
          myb_ref6_centre
          myb_ref6_schema
          sh3_ref6
          sh3_ref6_centre
          sh3_ref6_schema
          sushi_ref6
          sushi_ref6_centre
          sushi_ref6_schema
          trk_ref6
          trk_ref6_centre
          trk_ref6_schema
          zf_ref6
          zf_ref6_centre
          zf_ref6_schema
     test_1a/dead_ref6
             dead_ref6_centre
             dead_ref6_schema
             ktn+trk_ref6
             ktn+trk_ref6_centre
             ktn+trk_ref6_schema
             sh3_ref6
             sh3_ref6_centre
             sh3_ref6_schema
             sushi_ref6
             sushi_ref6_centre
             sushi_ref6_schema
             zf_ref6
             zf_ref6_centre
             zf_ref6_schema
     test_1b/dead_ref6
             dead_ref6_centre
             dead_ref6_schema
             ktn+trk_ref6
             ktn+trk_ref6_centre
             ktn+trk_ref6_schema
             sh3_1_ref6
             sh3_1_ref6_centre
             sh3_1_ref6_schema
             sh3_2_ref6
             sh3_2_ref6_centre
             sh3_2_ref6_schema
             sushi_ref6
             sushi_ref6_centre
             sushi_ref6_schema
             zf_ref6
             zf_ref6_centre
             zf_ref6_schema
     test_2a/apo_1_ref6
             apo_1_ref6_centre
             apo_1_ref6_schema
             apo_2_ref6
             apo_2_ref6_centre
             apo_2_ref6_schema
             apo_3_ref6
             apo_3_ref6_centre
             apo_3_ref6_schema
             kringle_1_ref6
             kringle_1_ref6_centre
             kringle_1_ref6_schema
             kringle_2_ref6
             kringle_2_ref6_centre
             kringle_2_ref6_schema
             lrr_1_ref6
             lrr_1_ref6_centre
             lrr_1_ref6_schema
             lrr_2_ref6
             lrr_2_ref6_centre
             lrr_2_ref6_schema
             lrr_3_ref6
             lrr_3_ref6_centre
             lrr_3_ref6_schema
             myb_1_ref6
             myb_1_ref6_centre
             myb_1_ref6_schema
             myb_2_ref6
             myb_2_ref6_centre
             myb_2_ref6_schema
             sh3_ref6
             sh3_ref6_centre
             sh3_ref6_schema
             sushi_ref6
             sushi_ref6_centre
             sushi_ref6_schema
     test_2b/ank_1_ref6
             ank_1_ref6_centre
             ank_1_ref6_schema
             ank_2_ref6
             ank_2_ref6_centre
             ank_2_ref6_schema
             ank_3_ref6
             ank_3_ref6_centre
             ank_3_ref6_schema
             ank_4_ref6
             ank_4_ref6_centre
             ank_4_ref6_schema
             apo_1_ref6
             apo_1_ref6_centre
             apo_1_ref6_schema
             apo_2_ref6
             apo_2_ref6_centre
             apo_2_ref6_schema
             apo_3_ref6
             apo_3_ref6_centre
             apo_3_ref6_schema
             kringle_1_ref6
             kringle_1_ref6_centre
             kringle_1_ref6_schema
             kringle_2_ref6
             kringle_2_ref6_centre
             kringle_2_ref6_schema
             ktn+trk_ref6
             ktn+trk_ref6_centre
             ktn+trk_ref6_schema
             lrr_1_ref6
             lrr_1_ref6_centre
             lrr_1_ref6_schema
             lrr_2_ref6
             lrr_2_ref6_centre
             lrr_2_ref6_schema
             myb_ref6
             myb_ref6_centre
             myb_ref6_schema
             sh3_1_ref6
             sh3_1_ref6_centre
             sh3_1_ref6_schema
             sh3_2_ref6
             sh3_2_ref6_centre
             sh3_2_ref6_schema
             sushi_1_ref6
             sushi_1_ref6_centre
             sushi_1_ref6_schema
             sushi_2_ref6
             sushi_2_ref6_centre
             sushi_2_ref6_schema
             sushi_3_ref6
             sushi_3_ref6_centre
             sushi_3_ref6_schema
             sushi_4_ref6
             sushi_4_ref6_centre
             sushi_4_ref6_schema
             sushi_5_ref6
             sushi_5_ref6_centre
             sushi_5_ref6_schema
             sushi_6_ref6
             sushi_6_ref6_centre
             sushi_6_ref6_schema
             trk_ref6
             trk_ref6_centre
             trk_ref6_schema
             zf_1_ref6
             zf_1_ref6_centre
             zf_1_ref6_schema
             zf_2_ref6
             zf_2_ref6_centre
             zf_2_ref6_schema
     test_2c/ank_1_ref6
             ank_1_ref6_centre
             ank_1_ref6_schema
             ank_2_ref6
             ank_2_ref6_centre
             ank_2_ref6_schema
             apo_1_ref6
             apo_1_ref6_centre
             apo_1_ref6_schema
             apo_2_ref6
             apo_2_ref6_centre
             apo_2_ref6_schema
             dead_ref6
             dead_ref6_centre
             dead_ref6_schema
             faa_1_ref6
             faa_1_ref6_centre
             faa_1_ref6_schema
             faa_2_ref6
             faa_2_ref6_centre
             faa_2_ref6_schema
             faa_3_ref6
             faa_3_ref6_centre
             faa_3_ref6_schema
             kringle_1_ref6
             kringle_1_ref6_centre
             kringle_1_ref6_schema
             kringle_2_ref6
             kringle_2_ref6_centre
             kringle_2_ref6_schema
             ktn+trk_1_ref6
             ktn+trk_1_ref6_centre
             ktn+trk_1_ref6_schema
             ktn+trk_2_ref6
             ktn+trk_2_ref6_centre
             ktn+trk_2_ref6_schema
             lrr_1_ref6
             lrr_1_ref6_centre
             lrr_1_ref6_schema
             lrr_2_ref6
             lrr_2_ref6_centre
             lrr_2_ref6_schema
             myb_1_ref6
             myb_1_ref6_centre
             myb_1_ref6_schema
             myb_2_ref6
             myb_2_ref6_centre
             myb_2_ref6_schema
             sh3_1_ref6
             sh3_1_ref6_centre
             sh3_1_ref6_schema
             sh3_2_ref6
             sh3_2_ref6_centre
             sh3_2_ref6_schema
             sh3_3_ref6
             sh3_3_ref6_centre
             sh3_3_ref6_schema
             sushi_1_ref6
             sushi_1_ref6_centre
             sushi_1_ref6_schema
             sushi_2_ref6
             sushi_2_ref6_centre
             sushi_2_ref6_schema
             sushi_3_ref6
             sushi_3_ref6_centre
             sushi_3_ref6_schema
             trk_ref6
             trk_ref6_centre
             trk_ref6_schema
             zf_1_ref6
             zf_1_ref6_centre
             zf_1_ref6_schema
             zf_2_ref6
             zf_2_ref6_centre
             zf_2_ref6_schema
     test_3/ank_1_ref6
            ank_1_ref6_centre
            ank_1_ref6_schema
            ank_2_ref6
            ank_2_ref6_centre
            ank_2_ref6_schema
            dead_ref6
            dead_ref6_centre
            dead_ref6_schema
            kringle_1_ref6
            kringle_1_ref6_centre
            kringle_1_ref6_schema
            kringle_2_ref6
            kringle_2_ref6_centre
            kringle_2_ref6_schema
            lrr_ref6
            lrr_ref6_centre
            lrr_ref6_schema
            sh3_ref6
            sh3_ref6_centre
            sh3_ref6_schema
            sushi_1_ref6
            sushi_1_ref6_centre
            sushi_1_ref6_schema
            sushi_2_ref6
            sushi_2_ref6_centre
            sushi_2_ref6_schema
     test_4/ank_1_ref6
            ank_1_ref6_centre
            ank_2_ref6
            ank_2_ref6_centre
            ank_ref6_schema
            lrr_1_ref6
            lrr_1_ref6_centre
            lrr_2_ref6
            lrr_2_ref6_centre
            lrr_3_ref6
            lrr_3_ref6_centre
            lrr_ref6_schema
            sh3_1_ref6
            sh3_1_ref6_centre
            sh3_2_ref6
            sh3_2_ref6_centre
            sh3_2_ref6_schema
            sh3_ref6_schema
            sushi_1_ref6
            sushi_1_ref6_centre
            sushi_2_ref6
            sushi_2_ref6_centre
            sushi_ref6_schema
            zf_1_ref6
            zf_1_ref6_centre
            zf_2_ref6
            zf_2_ref6_centre
            zf_ref6_schema

ref7/test/7tm_ref7
     test/Nat_ref7
          acr_ref7
          dtd_ref7
          ion_ref7
          msl_ref7
          photo_ref7
          ptga_ref7

ref8/test/cellulase_1_ref8
     test/cellulase_1_ref8_centre
          cellulase_1_ref8_schema
          cellulase_2_ref8
          cellulase_2_ref8_centre
          gsh_1_ref8
          gsh_1_ref8_centre
          gsh_1_ref8_schema
          gsh_2_ref8
          gsh_2_ref8_centre
          lectin_1_ref8
          lectin_1_ref8_centre
          lectin_1_ref8_schema
          lectin_2_ref8
          lectin_2_ref8_centre
          ptga_1_ref8
          ptga_1_ref8_centre
          ptga_1_ref8_schema
          ptga_2_ref8
          ptga_2_ref8_centre
          sh3+sh2_1_ref8
          sh3+sh2_1_ref8_centre
          sh3+sh2_1_ref8_schema
          sh3+sh2_2_ref8
          sh3+sh2_2_ref8_centre