DecoreTree

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DecoreTree est un outil web qui permet l'annotation et la colorisation des arbres phylogéniques créés par Itol.

Historique de la génèse de DecoreTree

J'avais fait des arbres avec Itol et je voulais les mettre en couleur ... Itol le permet mais ça ne marche pas bien, les fontes sont pas bonnes, etc. Itol permet l'exportation et le rapatriement du fichier SVG contenant le dessin. J'ai commencé à bidouillé ce fichier pour pouvoir l'afficher correctement.

Puis j'ai développé des fonctions Javascript pour le faire à l'écran.

Au 26 novembre 2013 on en est à :

  • un fichier decoretree_trululu.html contient les fonctions Javascript et le texte SVG décrivant l'arbre.
  • je respecte à peu près l'arbre d'origine de Itol.
    • il me semble que je modifie la première ligne ??? pour une histore de viewbox
    • on peut aussi rajouter des images ou du texte (les heatmaps par exemple)
  • à la fin il faut mettre la div de mise à hour et de coloration
 il faudra modifier tout ça pour inclure un fichier itol .svg localisé ailleurs ...

A+

Raymond