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LBGI

Vous êtes ici sur wikili le serveur wiki du LBGI Laboratoire de BioInformatique et Génomique Intégratives

Voir également lbgiki, le wiki privé resteint aux membres du laboratoire.

People

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• ALLOT Alexis allot@unistra.fr
• BERMEJO-DAS-NEVES Carlos carlos.bermejo-das-neves@etu.unistra.fr
• CHENNEN Kirsley kchennen@unistra.fr
• LECOMPTE Odile odile.lecompte@unistra.fr
• MOULINIER Luc luc.moulinier@unistra.fr
• MULLER Jean jeanmuller@unistra.fr
• NEY Anne anne.ney@unistra.fr
• NGUYEN Hoan ngochoannguyen@unistra.fr
• POCH Olivier olivier.poch@unistra.fr
• POIDEVIN Laetitia l.poidevin@unistra.fr
• POLVECHE Hélène polveche.helene@gmail.com
• RAFFELSBERGER Wolfgang w.raffelsberger@unistra.fr
• RIPP Raymond raymond.ripp@unistra.fr
• THOMPSON Julie thompson@unistra.fr
• VANHOUTREVE Renaud renaud.vanhoutreve@etu.unistra.fr
• WALTER Vincent v.walter@unistra.fr

Progiciels

Quel outil utilise quel outil ?

• BIRD Biological Integration and Retrivial Data
• Gscope en général
  • ... et Gscope Clonage en particulier
• Café des sciences sur Ouragan ou autre ...
• Subversion, notre outil de versionning
• obsolete: CVS Pour récupérer les dernières versions stables de programmes enregistrés sur le dépot.
• MACSIMS
• RReportGenerator .. c'est un graphical user interface pour des analyses statistiques avec rapports automatiques pour des applications de routine ..
• String nos outils pour s'en servir facilement
• Vep Variant Effect Predictor

Serveur et données

• Configuration minimale
• Installation PHP
• Où en sont nos serveurs Star, StarV, Surf, Lame1-14 Kilida et Alnitak et Eyear et Moby
• Source de données ... tous nos serveurs et bases de données
• Tout sur UCSCGenomes

Thématiques et Projets

Voir aussi la liste mise à jour dynamiquement des Thématiques du LBGI et visiter le site DBGS

• MicroVesicles stage de Anaïs Nicol
• Alvinella
• Fed Federating data a common achitecture to manage websites such as
  • Genoret
  • DBGS
  • Gx and its database GxDb
  • IdV for the Institut de la Vision
• ImAnno a web based annotation tool with a powerfull search engine
• GenoretGenes
• RetinoBase
• CADO4MI
• MAGOS
• JavOO

Outils programmation et Unix

• Tcl/Tk
• Java
• aide Unix
• Html et Javascript
• logiciels disponibles sur les serveurs.
• Bibliothèque interne