Difference between revisions of "GeneQuid"
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Revision as of 18:05, 15 July 2020
GeneQuid est construit comme Gscope, c'est un programme indépendant. Il est aussi implémenté en Café des sciences ce qui permet d'interroger rapidement et facilement les bases de données UniprotData, InterproData, et autres...
Résumé
Pour voir ce qui est disponible (principalement UniprotData et InterproData)
http://lbgi.fr/wscoperr?GeneQuid&Help
les procédures qui sont listées sont appelables avec les paramètres indiqués, le petit help qui suit donne quelques exemples
Comment ça marche
GeneQuid s'utilise
- en ligne de commande
/biolo/wscope/genequid/bin/qdsgenequid UniprotData P12345 ou plus simplement après s'être mis dans l'environnement GeneQuid par setgenequid (en tcsh) ou module load genequid (en bash) qgq UniprotData P12345 (qgq signifie Question à GeneQuid)
- directement en Tcl
GeneQuid UniprotData P12345
- par web
http://lbgi.fr/wscoperr?GeneQuid&UniprotData&P12345
En fait GeneQuid est comme Gscope (il est d'ailleurs sourcé par Gscope) ON peut faire
genequid puts Help genequid puts UniprotData P12345
qgq utilisant les café des sciences ne fait que de lancer genequid en café des sciences