gscope_blastomics.tcl
| Procedure Summary |
AliIndel { {Qui {}} {Quoi {}} {FicAli {}} } |
AliStat { {FichierAli {}} {CouOut {}} {PilOut {}} } |
AliStatPourTous { } |
bbsc { {Qui {}} {Quoi {}} {Quid {}} } |
BlastAli { Fichier {Nieme {}} {SeuilExpect {}} {MaxListe {}} } |
BlastAliComprime { Fichier } |
BlastAliStatPourTous { } |
BlastIndel { Fichier {Nieme {}} {SeuilExpect {}} {MaxListe {}} {Qui {}} {Quoi {}} } |
BlastomicsClades { {Quoi {}} {GetWhat {}} } |
BlastomicsCladesClaudineNeSertPlus { } |
BlastomicsCreateDb { {Project {}} {KindOfClades {}} {GetWhat {}} } |
BlastomicsCreateIndex { {Bdd {}} } |
BlastomicsDbDir { } |
BlastomicsDir { } |
BlastomicsFilterTaxobla { {Bdd {}} {ListOfPkOrg {}} {ListOfNot {}} {ListOfCladeCounts {}} } |
BlastomicsNewQuery { {Project {}} {KindOfClades {}} } |
BlastStat { {FichierBlast {}} {CouOut {}} {PilOut {}} } |
CanalSqlTaxobla { {Bdd {}} } |
CarEx { {Qui {}} {Quoi {}} {Quid {}} } |
CarExVerif { {Liste {}} } |
CdsFromDec2016 { ENST } |
CdsFromRefseq { Refseq } |
CladeContentWithinOi2017 { Clade {KindOfClades {}} } |
CreateMacsimXmlNuc { } |
CreateMsfAndMacsimFromTfaPourTous { } |
CreateNucAliFromProtAliBBSC { Nom } |
CreateNucAliFromProtAliBBSCPourTous { } |
CreateProjectBBSC { } |
DGB { }rR voir plus bas BlastAli BlastIndel BlastStat et |
FromBlastIndel { {Qui {}} {Quoi {}} args } |
InformeBBSCPourTous { } |
LesOsDesAcDeClaudine { } |
MrnaDesCopainsPourTous { {Liste {}} } |
MrnaFromPourTous { } |
MrnasFrom { Qui {FirstSeqOnly {}} } |
NicoMapping { {Qui {}} {Quoi {}} } |
OrganiseLesToposDeClaudine { } |
TBA { } |
TestBlastomicsSql { Projet Phylum } |
| Procedure Detail |
proc AliIndel { {Qui {}} {Quoi {}} {FicAli {}} }
proc AliStat { {FichierAli {}} {CouOut {}} {PilOut {}} }
proc AliStatPourTous { }
proc bbsc { {Qui {}} {Quoi {}} {Quid {}} }
proc BlastAli { Fichier {Nieme {}} {SeuilExpect {}} {MaxListe {}} }
proc BlastAliComprime { Fichier }
proc BlastAliStatPourTous { }
proc BlastIndel { Fichier {Nieme {}} {SeuilExpect {}} {MaxListe {}} {Qui {}} {Quoi {}} }
proc BlastomicsClades { {Quoi {}} {GetWhat {}} }
proc BlastomicsCladesClaudineNeSertPlus { }
proc BlastomicsCreateDb { {Project {}} {KindOfClades {}} {GetWhat {}} }
proc BlastomicsCreateIndex { {Bdd {}} }
proc BlastomicsDbDir { }
proc BlastomicsDir { }
proc BlastomicsFilterTaxobla { {Bdd {}} {ListOfPkOrg {}} {ListOfNot {}} {ListOfCladeCounts {}} }
proc BlastomicsNewQuery { {Project {}} {KindOfClades {}} }
proc BlastStat { {FichierBlast {}} {CouOut {}} {PilOut {}} }
proc CanalSqlTaxobla { {Bdd {}} }
proc CarEx { {Qui {}} {Quoi {}} {Quid {}} }
proc CarExVerif { {Liste {}} }
proc CdsFromDec2016 { ENST }
proc CdsFromRefseq { Refseq }
proc CladeContentWithinOi2017 { Clade {KindOfClades {}} }
proc CreateMacsimXmlNuc { }
proc CreateMsfAndMacsimFromTfaPourTous { }
proc CreateNucAliFromProtAliBBSC { Nom }
proc CreateNucAliFromProtAliBBSCPourTous { }
proc CreateProjectBBSC { }
proc DGB { }
proc FromBlastIndel { {Qui {}} {Quoi {}} args }
proc InformeBBSCPourTous { }
proc LesOsDesAcDeClaudine { }
proc MrnaDesCopainsPourTous { {Liste {}} }
proc MrnaFromPourTous { }
proc MrnasFrom { Qui {FirstSeqOnly {}} }
proc NicoMapping { {Qui {}} {Quoi {}} }
proc OrganiseLesToposDeClaudine { }
proc TBA { }
proc TestBlastomicsSql { Projet Phylum }