gscope_homolog.tcl Annotations

Procedure Detail

ChargeLesOrganismesAyantMemeOperon

proc ChargeLesOrganismesAyantMemeOperon {  }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 664

ChargeLesOrthologuesDe

proc ChargeLesOrthologuesDe {  }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 428

ChargeLesParaloguesDe

proc ChargeLesParaloguesDe { {Format {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 521

ChargeLesPositionsDesOrthologues

proc ChargeLesPositionsDesOrthologues { {Banque {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 1086

ChargeOrthologueDans

proc ChargeOrthologueDans {  }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 571

CompteDesOrganismesAyantMemeOperon

proc CompteDesOrganismesAyantMemeOperon { Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 630

CouleurSuivantOrganismesAyantMemeOperon

proc CouleurSuivantOrganismesAyantMemeOperon { Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 916

CreeLeFichierExpectDans

proc CreeLeFichierExpectDans { Banque }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 611

CreeLeFichierOrganismesAyantMemeOperon

proc CreeLeFichierOrganismesAyantMemeOperon { {Banque genomes} {SensSepares 0} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 747

CreeLeFichierOrthologueDans

proc CreeLeFichierOrthologueDans { Orga {OrgaEstUneBanque 0} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 590

DiffTaillesDesTroisOrthologuesDuMSF

proc DiffTaillesDesTroisOrthologuesDuMSF { NomOuFichier Bla DbC {Que {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 249

DiffTaillesDesTroisOrthologuesDuMSFPourTous

proc DiffTaillesDesTroisOrthologuesDuMSFPourTous {  }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 234

DotPlot

proc DotPlot { Banque {Orga {}} {DesProches {}} {PourGif {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 1182

DotPlotParalogues

proc DotPlotParalogues {  }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 1257

ExisteOrthologueDans

proc ExisteOrthologueDans { Orga Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 415

HistogrammeDuNombreDeParalogues

proc HistogrammeDuNombreDeParalogues { {Format Graphe} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 485

ListeDesOrganismesAyantMemeOperon

proc ListeDesOrganismesAyantMemeOperon { Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 651

NombreDeHomologues

proc NombreDeHomologues { Nom {Type homo} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 365

NombreDeOrganismesOrthologues

proc NombreDeOrganismesOrthologues { Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 361

NombreDeOrthologues

proc NombreDeOrthologues { Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 357

NombreDeParaloguesDe

proc NombreDeParaloguesDe { Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 495

NombreDOrganismesAyantMemeOperons

proc NombreDOrganismesAyantMemeOperons { Nom }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 911

OrganismesAyantMemeOperon

proc OrganismesAyantMemeOperon { lPA lOA lPB lOB }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 713

OrganismesOrthologues

proc OrganismesOrthologues { K X Y }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 466

OrthologueDansTBlastN

proc OrthologueDansTBlastN { Nom Orga {OrgaEstUneBanque 0} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 1017

OuATapeBlastX

proc OuATapeBlastX { Fichier {QuoiRetourner {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 120

OuATapeTBlastX

proc OuATapeTBlastX { Fichier Banque QuoiRetourner }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 3

ParaloguesDe

proc ParaloguesDe { Nom {Format {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 499

PositionsDesOrthologues

proc PositionsDesOrthologues { Nom Banque {Orga {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 1166

RelieLesOperons

proc RelieLesOperons { K Position }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 948

SautParalogue

proc SautParalogue { K X Y }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 549

TestYaOrthologue

proc TestYaOrthologue {  }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 313

YaOrthologue

proc YaOrthologue { Nom Orga {Genome {}} }

Defined in:

gscope_homolog.tcl, line 329