gscope_misc.tcl Annotations

Procedure Detail

AAduCodon

proc AAduCodon { Codon {AA {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8049

AAStart

proc AAStart { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8006

AddOrganismToOrgaCode

proc AddOrganismToOrgaCode { {NewOrga {}} {NewOrga2 {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7118

AfficheArbre

proc AfficheArbre { Arbre }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3909

AfficheLesSortiesBlast

proc AfficheLesSortiesBlast { Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6916

AfficheUneSequence

proc AfficheUneSequence { {NomDuFichier {}} {AvecManiere {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6922

AfficheUneSortieBlast

proc AfficheUneSortieBlast { {NomDuFichier {}} {AvecManiere {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6933

AfficheUsageDesCodons

proc AfficheUsageDesCodons { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2392

AideEnLigne

proc AideEnLigne { Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5553

AlignePar

proc AlignePar { Aligneur Selection Mode {NomOuNum {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 988

Aligneurs

proc Aligneurs { {LeQuel {}} {Defaut {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1097

AppendEtRetourneDistance

proc AppendEtRetourneDistance { Arbre Distance }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3790

ArbreBootstrapEnListe

proc ArbreBootstrapEnListe { TextePH }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3887

ArbreBootstrapEnListeOld

proc ArbreBootstrapEnListeOld { TextePH }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3869

ArbreEnListe

proc ArbreEnListe { TextePH }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3938

ArkaeaLike

proc ArkaeaLike { Orga }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2698

BeauCodeGenetique

proc BeauCodeGenetique {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 48

BeauGN

proc BeauGN { GN }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7923

BeauScore

proc BeauScore {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5733

BestDefinitionOfBlastP

proc BestDefinitionOfBlastP { Nom {SeuilExpect {}} {ForbidenWordInDE {}} {RepDuBlast {}} {UseFirstDE {}} {NoAccessInHit {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1839

BestDefinitionOfBlastPPourTous

proc BestDefinitionOfBlastPPourTous { {SeuilExpect {}} {ForbidenWordInDE {}} {RepDuBlast {}} {UseFirstDE {}} {NoAccessInHit {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1825

BestDefinitionOfBlastX

proc BestDefinitionOfBlastX { Nom {SeuilExpect {}} {ForbidenWordInDE {}} {RepDuBlast {}} {UseFirstDE {}} {NoAccessInHit {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1834

BestDefinitionOfBlastXPourTous

proc BestDefinitionOfBlastXPourTous { {SeuilExpect {}} {ForbidenWordInDE {}} {RepDuBlast {}} {UseFirstDE {}} {NoAccessInHit {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1816

BestDefinitionOfDbClustal

proc BestDefinitionOfDbClustal { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1757

BestDefinitionOfDbClustalPourTous

proc BestDefinitionOfDbClustalPourTous {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1749

BestDefinitionOfLeon

proc BestDefinitionOfLeon { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1784

BestDefinitionOfLeonPourTous

proc BestDefinitionOfLeonPourTous {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1775

BlastWithAllExpectsToZero

proc BlastWithAllExpectsToZero { Fichier {Nouveau {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 381

BlastXsurZone

proc BlastXsurZone { K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5011

Boo

proc Boo { Fichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3864

BornesDeSeraphinVersCasimir

proc BornesDeSeraphinVersCasimir {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2815

BoutADN

proc BoutADN { {Debut 1} {Fin -1} {Orient F} {Banque {}} {aProbleme {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5401

BoutADNDuTFA

proc BoutADNDuTFA { Deb Fin Orient {FichierTFA {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5364

BoutADNDuTFAOldVersionSansMemoParFichier

proc BoutADNDuTFAOldVersionSansMemoParFichier { Deb Fin Orient {FichierTFA {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5383

Cas

proc Cas { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1442

CasimirDu

proc CasimirDu { Ser }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2866

Censure

proc Censure { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7896

CetteFeuilleEstLaCible

proc CetteFeuilleEstLaCible { Arbre }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3763

CG

proc CG { X }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 158

ChangeLaCommande

proc ChangeLaCommande { Coco }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6346

ChangeOrdrePhylo

proc ChangeOrdrePhylo { K x y HL Sens nOrgas }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3426

ChaqueHitDuBlastP

proc ChaqueHitDuBlastP { Fichier {AvecLaSeq {}} {Cible {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4459

ChaqueProteineDuBlastX

proc ChaqueProteineDuBlastX { Fichier {AvecLaSeq {}} {Cible {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4463

ChaqueProteineDuTBlastN

proc ChaqueProteineDuTBlastN { Fichier {AvecLaSeq {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4306

ChargeCodonPreference

proc ChargeCodonPreference {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5534

ChargeLesCodonsStart

proc ChargeLesCodonsStart {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7984

ChargeNombreDeCopainsDansBlast

proc ChargeNombreDeCopainsDansBlast {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8495

ChargePhylons

proc ChargePhylons {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2738

ChargeSeraphinEtCasimir

proc ChargeSeraphinEtCasimir {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2898

ChoisiEtAjouteChampsInfo

proc ChoisiEtAjouteChampsInfo { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5320

ChoixDesPresents

proc ChoixDesPresents { Liste {ListeDeTextes {}} {Invite {Select ... and validate.}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6381

ChoixGN

proc ChoixGN { ListeDesGN }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6354

ChoixMultiple

proc ChoixMultiple { Liste {ListeDeTextes {}} {Invite {Select ...}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6505

ClasseFonctionnelle

proc ClasseFonctionnelle { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1958

ClasseFonctionnelleDansFonctionsValidees

proc ClasseFonctionnelleDansFonctionsValidees { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1989

ClasseFonctionnelleDansInfo

proc ClasseFonctionnelleDansInfo { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1976

ClasseNormalisee

proc ClasseNormalisee { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5349

ClosCanalEtMontreBlaste

proc ClosCanalEtMontreBlaste { Canal Out }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6594

ClosCanalEtMontreMSF

proc ClosCanalEtMontreMSF { Aligneur Canal MSF Log }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6607

ClosExpoCourante

proc ClosExpoCourante {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6619

ClosGalerieCourante

proc ClosGalerieCourante {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6624

ClustalX

proc ClustalX { MSF {IsFile {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2631

CocheAligneurs

proc CocheAligneurs {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1041

CochonsLes

proc CochonsLes { SesMachins SesMachinsDefaut }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6634

CodeGenetique

proc CodeGenetique { {Qui {}} {Quoi {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 70

CodonsDuAA

proc CodonsDuAA { AA }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8045

Colle

proc Colle { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6684

CompareADN

proc CompareADN { Page {SansAffichage {}} {Titre {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8112

CompareADNDesFichiersTFA

proc CompareADNDesFichiersTFA { F1 F2 {SansAffichage {}} {Titre {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8106

CompareADNDesTextesTFA

proc CompareADNDesTextesTFA { T1 T2 {SansAffichage {}} {Titre {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8099

CompareLesARNs

proc CompareLesARNs { K L }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3

CompareLesExpectsDesSegments

proc CompareLesExpectsDesSegments { TexteA TexteB }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3031

CompleteLeFichierErreurs

proc CompleteLeFichierErreurs { Fichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3735

Comptons

proc Comptons {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3492

ComptonsLesATGC

proc ComptonsLesATGC {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3462

ConcordanceNumerotationDesIntergenes

proc ConcordanceNumerotationDesIntergenes { Ancien Nouveau }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4882

CoordDuCourant

proc CoordDuCourant { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6723

CopieLeMeilleurCopainsInfo

proc CopieLeMeilleurCopainsInfo { Nom Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7927

CorrigeLesOrganismesDansDisphy

proc CorrigeLesOrganismesDansDisphy {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 909

CorrigeLesOutliers

proc CorrigeLesOutliers {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5680

CorrigeValiGNSiPresenceName

proc CorrigeValiGNSiPresenceName {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 898

CouleurDePeau

proc CouleurDePeau { Access }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6730

CouleurDePeauOsOc

proc CouleurDePeauOsOc { OsOc }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6736

CourtOS

proc CourtOS { OS }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7919

CreateRandomTfa

proc CreateRandomTfa { {Fichier {}} {N {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 198

CreeADNetTDNetRAC

proc CreeADNetTDNetRAC { SequenceBrute {Extension {}} {Rep {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8697

CreeADNetTDNetRACaPartirDuFichierBrut

proc CreeADNetTDNetRACaPartirDuFichierBrut { Fichier {Start {}} {Extension {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8692

CreeExpo

proc CreeExpo { E }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6753

CreeGalerie

proc CreeGalerie { G }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6766

CreeImagette

proc CreeImagette {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6803

CreeLeFichierDansNucTfa

proc CreeLeFichierDansNucTfa { Nom Debut Fin Orient }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8626

CreeLeFichierDistancesPhylo

proc CreeLeFichierDistancesPhylo {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3602

CreeLeFichierFonctionsDecouvertes

proc CreeLeFichierFonctionsDecouvertes {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3041

CreeLeFichierFonctionsValidees

proc CreeLeFichierFonctionsValidees {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2661

CreeLeFichierNombreDeCopainsDansBlast

proc CreeLeFichierNombreDeCopainsDansBlast { {Source {}} {SeuilExpect {}} {Extension {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8500

CreeLeFichierPhylo

proc CreeLeFichierPhylo { FichierMSF FichierPhylo }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3702

CreeLesFichiersNucTfa

proc CreeLesFichiersNucTfa { {Liste {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8595

CreeLesFichiersPhylos

proc CreeLesFichiersPhylos { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3709

CreeLesFichiersTfas

proc CreeLesFichiersTfas {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5307

CreeLesFichiersTFAsNUCsAvecBornesDesPABsEtADN

proc CreeLesFichiersTFAsNUCsAvecBornesDesPABsEtADN {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2792

CreeLesInfosDesTRNAs

proc CreeLesInfosDesTRNAs {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2015

CreeLesInfosDuGenescope

proc CreeLesInfosDuGenescope { Fichier Repertoire }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4853

CreeOuATapeBlastX

proc CreeOuATapeBlastX { {Banque {}} {AvecOrganismes {}} {AvecPositions {}} {AvecDupliques {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4128

CreeOuATapeTBlastN

proc CreeOuATapeTBlastN { {Banque {}} {AvecOrganismes {}} {AvecPositions {}} {AvecDupliques {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4179

CreePourcentageIdentite

proc CreePourcentageIdentite { {Banque genomes} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1403

CreeToutesLesNotes

proc CreeToutesLesNotes { {Liste {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1530

CreeToutesLesNotesPourCollection

proc CreeToutesLesNotesPourCollection {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1493

CreeToutesLesSynthetases

proc CreeToutesLesSynthetases { {QueLaListe {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 936

DecortiqueBlast

proc DecortiqueBlast { TexteOuListeOuFichier {CutPN {}} {MaxListe {}} {aQuery {}} {alBanqueId {}} {alAccess {}} {alDE {}} {alProfil {}} {alPN {}} {alPartieSegAli {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5958

DecortiqueBlastCommeBlat

proc DecortiqueBlastCommeBlat { TexteListeOuFichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 245

DecortiqueBlat

proc DecortiqueBlat { TexteListeOuFichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 249

DecortiqueFetch

proc DecortiqueFetch { TexteGCG ChampsDuFetch }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6830

Dedouble

proc Dedouble { Arbre aG ax aD ay }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3769

Definition

proc Definition { Nom {Approx {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1917

DefinitionApproximative

proc DefinitionApproximative { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1913

DefinitionDuAccess

proc DefinitionDuAccess { BanqueId {Access {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7568

DefinitionRapide

proc DefinitionRapide { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1909

DeleteJunkdir

proc DeleteJunkdir { {Qui {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 882

DeleteLesTmp

proc DeleteLesTmp { Selection Fenetre }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6857

Deselecte

proc Deselecte { K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4808

DessineOrgaEtSesPlaces

proc DessineOrgaEtSesPlaces { {Fichier {}} {PourGif {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3180

Detoure

proc Detoure { Boite K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5196

DiagnostiqueLesPhylosFolles

proc DiagnostiqueLesPhylosFolles {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2240

DiagnostiquePhyloFolle

proc DiagnostiquePhyloFolle { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2226

DismissToutCePAB

proc DismissToutCePAB { Nom {Force {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7879

DuGrec

proc DuGrec { Fichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1135

EffaceCourant

proc EffaceCourant { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6871

ElimineLesEnterres

proc ElimineLesEnterres {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1463

EnsoleilleLaSelection

proc EnsoleilleLaSelection { Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6879

Entoure

proc Entoure { Boite K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5181

EspeceNormalisee

proc EspeceNormalisee { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5356

EstPABouTROUouTRNAouARN

proc EstPABouTROUouTRNAouARN { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1156

EstUneFeuille

proc EstUneFeuille { Arbre }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3755

EstUnPAB

proc EstUnPAB { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1180

EtudieAccess

proc EtudieAccess { Access }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6897

EtudieCourant

proc EtudieCourant { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6911

EtudieLesNucleiquesDe

proc EtudieLesNucleiquesDe { GenomeCourant }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8664

EtudieLesProteinesDe

proc EtudieLesProteinesDe { GenomeCourant }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8651

EtudieUneSortieMSF

proc EtudieUneSortieMSF { {NomDuFichier {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6950

Expose

proc Expose { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6961

ExpressionReguliereDesPABs

proc ExpressionReguliereDesPABs {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1185

ExtractRandomLinesFromFile

proc ExtractRandomLinesFromFile { Fichier N {Seed {}} {Start {}} {Stop {}} {GetWhat {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 212

ExtraireDe

proc ExtraireDe { Ligne aNom aDebut aFin aOrient }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2195

ExtraitInfo

proc ExtraitInfo { Nom {Champ {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5595

ExtraitTouteInfo

proc ExtraitTouteInfo { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5577

Fard

proc Fard { K X Y }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7973

FetchCat

proc FetchCat { Access {Quoi {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5662

FetcheCourant

proc FetcheCourant { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6972

FetchNoms

proc FetchNoms { Access }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5668

FetchTest

proc FetchTest { Access }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5674

FiabiliteFonction

proc FiabiliteFonction { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4827

FichierFOF

proc FichierFOF { Selection {Tmp {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6976

FormateSequence

proc FormateSequence { Sequence {NouveauFormat {}} {AncienFormat {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7074

Glossaire

proc Glossaire { {Organisme {}} {Champ {}} {ChampSiOrgaSur2 {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7218

GNduMarque

proc GNduMarque { Marque }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7871

HauteurDe

proc HauteurDe { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7577

Histogramme

proc Histogramme { ListeDeNombres {Sortie {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8311

HistogrammeDuFichier

proc HistogrammeDuFichier { Fichier {Sortie {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8302

HistogrammeDuNombreDeCopainsDansBlast

proc HistogrammeDuNombreDeCopainsDansBlast {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8288

HistogrammeDuTas

proc HistogrammeDuTas { Fichier {LesTabs {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1308

IllumineLeGroupeDe

proc IllumineLeGroupeDe { Nom Fenetre {Ask {}} {Maniere {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7582

InfoInteressante

proc InfoInteressante { Ligne }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4845

Informe

proc Informe { Nom {Append {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8370

InformeFromBestBlastHit

proc InformeFromBestBlastHit { Nom {SansDemander {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5939

InformeFromBestBlastHitPourTous

proc InformeFromBestBlastHitPourTous {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5931

InformeLesMetsCorriges

proc InformeLesMetsCorriges {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3138

InformeParMiseAJourPourTous

proc InformeParMiseAJourPourTous { {Commande {}} {Champ {}} {Test 0} {Ask 0} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5495

InformeParSuppressionDuChamp

proc InformeParSuppressionDuChamp { Nom Champ {PourVoir {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5464

InformeParSuppressionDuChampPourTous

proc InformeParSuppressionDuChampPourTous { Champ }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5456

InformeSansDemander

proc InformeSansDemander { Nom {Append {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8353

InformeSansDemanderParWscope

proc InformeSansDemanderParWscope { Nom Page }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8365

KillPython

proc KillPython {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 174

KillQds

proc KillQds {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 186

Lance

proc Lance { Aligneur Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 961

LargeurDe

proc LargeurDe { w }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7602

LesChampsInteressantsDuAccess

proc LesChampsInteressantsDuAccess { BanqueId Access args }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7455

LesFrames

proc LesFrames {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6377

LesHitsDuBlast

proc LesHitsDuBlast { Fichier {SeuilExpect 0.001} {MaxListe 99999} {Quoi {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5913

LesNomsPiques

proc LesNomsPiques {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5170

LesOffsetsDePfur

proc LesOffsetsDePfur {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3162

LesOrgasDesAccess

proc LesOrgasDesAccess { LesAccess {Champ Complet} {Nom {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7370

LesPresentsAbsentsIndifferents

proc LesPresentsAbsentsIndifferents { Liste {ListeDeTextes {}} {Invite {Select ... and validate.}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6385

ListeCompressee

proc ListeCompressee { liste }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7607

ListonsLesTrous

proc ListonsLesTrous { LongMotif Offset }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1227

LoadTxl

proc LoadTxl { Fichier {aTxl {}} {MainIndex 0} {Sep {}} {CoLi {}} {WholeLine {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 801

LoadTxlWithRowsOfCells

proc LoadTxlWithRowsOfCells { Fichier {aTxl {}} {MainIndex 0} {Sep {}} {CoLi {}} {WholeLine {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 712

MarqueLesErreursDeSequence

proc MarqueLesErreursDeSequence { K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2940

MenageLesTmp

proc MenageLesTmp { Vert {Choix {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7618

MetExtreme

proc MetExtreme { Seq Depart }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 471

MiseAJourAvecLesInfosDuGenoscope

proc MiseAJourAvecLesInfosDuGenoscope {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4833

MiseAJourDesNouveaux

proc MiseAJourDesNouveaux {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5232

MiseAJourDesPABCrees

proc MiseAJourDesPABCrees {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3112

MontreCourant

proc MontreCourant { w x y }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7654

MontreNomSuperClassePI

proc MontreNomSuperClassePI { Nom Orga }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1366

MontreOrganismes

proc MontreOrganismes { {AvecRetour {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7681

MontreTousCeuxQuiSont

proc MontreTousCeuxQuiSont { CommeCa {Orga {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1349

MoyenneDesPourcentages

proc MoyenneDesPourcentages {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1205

MultiAlignePlusieursAby

proc MultiAlignePlusieursAby { Aligneur Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8277

NJPlotMSF

proc NJPlotMSF { MSF {IsFile {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2643

NJPlotPH

proc NJPlotPH { FichierPhylo }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2656

NombreDeCopainsDansBlast

proc NombreDeCopainsDansBlast { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8468

NomCompletDeLaSuperClasse

proc NomCompletDeLaSuperClasse { SP }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1370

NomDeGene

proc NomDeGene { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1739

NomDeGeneIssuDeDefinitionApproximative

proc NomDeGeneIssuDeDefinitionApproximative { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1730

NomDeGeneIssuDeDefinitionApproximativePourTous

proc NomDeGeneIssuDeDefinitionApproximativePourTous { {Ask {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1699

NomDeLaFeuille

proc NomDeLaFeuille { Arbre }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3759

NomDuCourant

proc NomDuCourant { K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7716

NormaliseTxlFieldName

proc NormaliseTxlFieldName { Field }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 616

Note

proc Note { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1485

NucDuCodonStart

proc NucDuCodonStart { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8015

NucExtension5Prime

proc NucExtension5Prime { NucTotal Nuc3Prime }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 517

NumeroDu

proc NumeroDu { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1200

OffsetDansEnteteSegAli

proc OffsetDansEnteteSegAli { Ligne {BanqueBlast {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4120

OrgaDuAccess

proc OrgaDuAccess { Access {Champ Complet} {BanqueId {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7490

OrganismeDeLaLigneTBlastN

proc OrganismeDeLaLigneTBlastN { Ligne }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4647

OrganismeNormalise

proc OrganismeNormalise { Organisme {Champ {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7555

OrganismePrioritaire

proc OrganismePrioritaire { Orga }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7178

OuATapeTBlastN

proc OuATapeTBlastN { Fichier Banque QuoiRetourner }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4229

OutlierOrganism

proc OutlierOrganism { {Orga {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5693

OutlierOrganismInBlast

proc OutlierOrganismInBlast { Nom {Outlier {}} {Clade {}} {Seuil {}} {GetWhat {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5850

OutlierOrganismInBlastPourTous

proc OutlierOrganismInBlastPourTous { {Outlier {}} {Clade {}} {Seuil {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5839

OutlierScore

proc OutlierScore { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5745

PartieSegAli

proc PartieSegAli { Page LigneAccess }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4786

PcrProduct

proc PcrProduct { Oli5 Seq Oli3 {GetWhat {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8776

PhyloFolle

proc PhyloFolle { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2706

Phylon

proc Phylon { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2770

PhylonOrgaEtDistance

proc PhylonOrgaEtDistance { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2780

PiqueBox

proc PiqueBox { K X Y Action }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5210

PNApres

proc PNApres { Champ dans Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4302

PointeLesErreursDeSequence

proc PointeLesErreursDeSequence {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2971

PreFixe

proc PreFixe { {Nouveau {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1191

Presente

proc Presente { Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5147

ProtDansNuc

proc ProtDansNuc { TFA Pro }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 531

PrrpDesMSF

proc PrrpDesMSF {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3972

PrrpDuMSF

proc PrrpDuMSF { FichierMSF }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3991

PyroLike

proc PyroLike { Orga }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2693

QueDitCohen

proc QueDitCohen { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5139

QueDitYvan

proc QueDitYvan { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5121

QueryDuBlast

proc QueryDuBlast { Fichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 374

QuiEstLa

proc QuiEstLa { DebutSeq FinSeq Banque }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4046

RandomAdnFromProteinSequence

proc RandomAdnFromProteinSequence { {Seq {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 32

RangeLeFichier

proc RangeLeFichier { Fichier dans Destination }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5287

RangeLesFichiers

proc RangeLesFichiers { Extension }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5273

ReBaptiseLaSequenceGCG

proc ReBaptiseLaSequenceGCG { Sequence NomDeBapteme }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3959

ReBaptiseLaSequenceTFA

proc ReBaptiseLaSequenceTFA { Sequence NomDeBapteme }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3952

ReferenceClade

proc ReferenceClade { {Orga {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5713

RemplaceAccessParOrganismeDansFichierPhylo

proc RemplaceAccessParOrganismeDansFichierPhylo { Nom {Out {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3647

RemplaceAccessParOrganismeDansFichierPhyloPourTous

proc RemplaceAccessParOrganismeDansFichierPhyloPourTous { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3630

RemplaceAccessParPABPourTous

proc RemplaceAccessParPABPourTous { {Rep {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 348

RenommageAFaire

proc RenommageAFaire {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2046

RenommeExtension

proc RenommeExtension { Avant Apres {Rep {}} {Ask {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 440

RenommeLesTmp

proc RenommeLesTmp { Selection Fenetre }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7724

RenommeTousLesFichiersDesSousRepertoires

proc RenommeTousLesFichiersDesSousRepertoires { Ancien Nouveau }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2034

RepereNuc

proc RepereNuc { Position K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4019

RepereNucOuBox

proc RepereNucOuBox { Ca K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4010

RepriseDesPABsCitesDans

proc RepriseDesPABsCitesDans { FOF }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2066

ReprisePAB

proc ReprisePAB { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2072

RowsOfCells

proc RowsOfCells { Texte {Separateur {}} {NewSep {}} {NewQQ {}} {NewRet {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 627

SavePhylOrder

proc SavePhylOrder { K OrgaEtSesPlaces }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3376

SeeADN

proc SeeADN { FichierPep }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8682

SeeBlast

proc SeeBlast { Fichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8676

SeqIn

proc SeqIn { {Texte {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7741

SeqToTfa

proc SeqToTfa { FichierSeq {FichierTFA {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 580

SeqToTfaPourTous

proc SeqToTfaPourTous {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 572

SeraphinDu

proc SeraphinDu { Cas }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2883

ShowFile

proc ShowFile { {Fichier {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7830

ShowFileOld

proc ShowFileOld { {Fichier {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7780

ShowNuc

proc ShowNuc { K X Y Action {PositionNucleique 0} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5035

SignalDAutresHomologues

proc SignalDAutresHomologues { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1693

SimilitudeSurUneZone

proc SimilitudeSurUneZone { i j }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2959

SiteHybridisation

proc SiteHybridisation { SeqO Sequence {FouR {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8799

SixBlastPsurPique

proc SixBlastPsurPique { Pique }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4960

SixBlastPsurPiques

proc SixBlastPsurPiques { Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4954

SixBlastPsurZone

proc SixBlastPsurZone { K }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4979

SoleilsDesBlasts

proc SoleilsDesBlasts { Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4630

SoleilsDesTBlastNs

proc SoleilsDesTBlastNs { Selection }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4621

StatistiquesSurLesProteines

proc StatistiquesSurLesProteines { {QuelleListe {}} {EnContinu {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3551

StopAvant

proc StopAvant { Seq {Depart {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 501

StopProchain

proc StopProchain { Seq {Depart {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 485

SuperClasse

proc SuperClasse { Classe }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1385

TCNI

proc TCNI {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 4871

TestAAduCodon

proc TestAAduCodon {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8031

TestArbreEnListe

proc TestArbreEnListe { {args {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3929

TestCA

proc TestCA {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8095

TestCG

proc TestCG { {Seq {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 27

TestChoixParmi

proc TestChoixParmi {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 6370

TestDecortiqueBlat

proc TestDecortiqueBlat { Fichier }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 235

TestGlossaire

proc TestGlossaire {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7172

TestLODB

proc TestLODB { fileBlast }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5902

TestonsExec

proc TestonsExec {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 146

TestPcrProduct

proc TestPcrProduct {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8766

TestPDB

proc TestPDB {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8836

TestRowsOfCells

proc TestRowsOfCells {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 621

TexteOMO

proc TexteOMO { NomVoulu {Format Court} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3073

TFAtoGDE

proc TFAtoGDE { LesLignesTFA }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 7853

Toggle

proc Toggle { SaVariable }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5571

ToggleCanva

proc ToggleCanva { K Tag }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1424

ToggleTextePhylo

proc ToggleTextePhylo { K {Qui Both} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 3404

UsageDesCodons

proc UsageDesCodons { NomVoulu }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2502

UsageDesCodonsEtCodeCirculaire

proc UsageDesCodonsEtCodeCirculaire {  }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2256

Validation

proc Validation { {Sens -increasing} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 2913

ValiDE

proc ValiDE { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5581

ValiGN

proc ValiGN { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 5588

VersPoubelle

proc VersPoubelle { Nom }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 544

VoisinADN

proc VoisinADN { NomOuTexte {Debut {}} {Fin {}} {Orient {}} {SansAffichage {}} {Titre {}} }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 8126

VraiDEDeLaLigneDE

proc VraiDEDeLaLigneDE { Ligne }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 427

VraiGNDeLaLigneGN

proc VraiGNDeLaLigneGN { Ligne }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 417

YaPABdans

proc YaPABdans { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1174

YaPABenDebutDe

proc YaPABenDebutDe { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1169

YaPABouTROUouTRNAouARNdans

proc YaPABouTROUouTRNAouARNdans { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1163

YaPABouTROUouTRNAouARNenDebutDe

proc YaPABouTROUouTRNAouARNenDebutDe { Texte }

Defined in:

gscope_misc.tcl, line 1150