gscope_select.tcl Annotations

Procedure Detail

AfficheReduceMsf

proc AfficheReduceMsf { NomOuFichier {MinAB {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 50

AfficheSortedDistances

proc AfficheSortedDistances { NomOuFichier }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 45

BlastReduit

proc BlastReduit { NomOuFichier ListeDesHits {AGarder {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 466

BlastTrieDuPsiBlastPourTous

proc BlastTrieDuPsiBlastPourTous {  }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 335

CreeLeFichierTFAsDesAccessDuBlastPPourTous

proc CreeLeFichierTFAsDesAccessDuBlastPPourTous { {RepTFAs {}} {SeuilExpect {}} {MaxListe {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 318

DernierBlastDuPsiBlast

proc DernierBlastDuPsiBlast { FicPsiBlast {Trie {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 407

DernierBlastDuPsiBlastPourTous

proc DernierBlastDuPsiBlastPourTous { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 386

EstUnAccessSwissprot

proc EstUnAccessSwissprot { Access }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 555

LesBandelettesDuBlast

proc LesBandelettesDuBlast { FichierOuNom {Source {}} {AvecSize {}} {OnGraphe {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 737

LesBlastsDuPsiBlast

proc LesBlastsDuPsiBlast { Fichier {Nieme {}} {Trie {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 413

LesElusDuBlastPAuChoixPourTous

proc LesElusDuBlastPAuChoixPourTous { {Source {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 573

LesElusDuBlastPParAuChoix

proc LesElusDuBlastPParAuChoix { Nom {Source {}} {Show {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 679

LesElusDuBlastPParBandelettes

proc LesElusDuBlastPParBandelettes { Nom {Source {}} {Show {}} {SeuilExpect {}} {LoinToujours {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 580

LesElusDuBlastPParBandelettesPourTous

proc LesElusDuBlastPParBandelettesPourTous { {Source {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 559

LesElusDuBlastPParMounir

proc LesElusDuBlastPParMounir { Nom {Source {}} {Show {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 708

LesElusDuBlastPParMounirPourTous

proc LesElusDuBlastPParMounirPourTous { {Source {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 566

LoinToujours

proc LoinToujours { PN {Action {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 191

LoinToujoursTest

proc LoinToujoursTest {  }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 173

MounirDuBlast

proc MounirDuBlast { NomOuFichier {FichierSortie {}} {SeuilExpect {}} {MaxListe {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 226

MsfDesMAFFTPourTous

proc MsfDesMAFFTPourTous {  }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 279

MsfDesTFAsPourSapPourTous

proc MsfDesTFAsPourSapPourTous {  }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 266

PairwizeDistancesInMsf

proc PairwizeDistancesInMsf { A {B {}} {Fichier {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 109

ProtocoleDuProttfaAuMacsim

proc ProtocoleDuProttfaAuMacsim { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 1

ProtocolePeroxisome

proc ProtocolePeroxisome { {Nom {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 26

PsiBlast

proc PsiBlast { FichierTFA {FichierPsiBlast {}} {Banque {}} {Options {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 348

ReduceMsf

proc ReduceMsf { NomOuFichier {FicOut {}} {MinAB {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 55

SelectPdbForRefX

proc SelectPdbForRefX { InFile OutFile {Cutoff {}} {MatBla {}} {LogFile {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 305

SelectPdbForRefXPourTous

proc SelectPdbForRefXPourTous {  }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 292

ShowLesBlastsDuPsiBlast

proc ShowLesBlastsDuPsiBlast { Fichier {Nieme {}} }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 368

TestBlastReduit

proc TestBlastReduit {  }

Defined in:

gscope_select.tcl, line 461