gscope_specific.tcl
| Procedure Summary |
AccessHNR { } |
ALaMain { Quoi } |
AlviCreePpcrProt { } |
AlviVerif { } |
BalibaseCorrectLink { } |
BalibaseCreateBlastDatabase { }rR |
Bathy2010 { {Action {}} } |
BathyCompositionContig { {Qui {}} {Quoi {}} } |
BestHitReciproc { Nom {BlastDir {}} {CutPN {}} {HitOnly {}} } |
BestHitReciprocPourTous { {BlastDir {}} {CutPN {}} {HitOnly {}} } |
BestInformePourBathy { } |
BlastYEAH { {Start {}} {Stop {}} } |
CanvaPuzz { } |
ClonePuzzleFit { {OrgaCible {}} {PrefixeCible {}} {Destin {}} } |
CorrigeHistolica { } |
CorrigeInfosU33p2 { } |
CorrigeMGU { } |
CorrigeSynMito { } |
CorrigeU133 { {Rep {}} } |
CreateGscopeProjectGAL4 { } |
CreateOligosAndPpcrForAlvi { } |
CreateTfasForYEAH { Qui } |
CreeLesSynthetases { Fichier Destination {AA {}} {AAOrig {}} } |
CreeProtTfaPhorDeGenEmbl { } |
DecortiqueBlastYEAH { {Start {}} {Stop {}} {Attendre {}} } |
DeDoubleYEAHpa { } |
DispatchCluspack { } |
DoubleFof { } |
ExchangeColumns { FilIn {FilOut {}} } |
GenomiqueComparativeParBlast { {RepBlast {}} } |
GetQS { Fichier } |
GoodAccessForHam { } |
InfHomolog { {Qui {}} {Quoi {}} {Ou {}} } |
InformeAliasWithACIfNotGNPourTous { MauvaisAlias MauvaisGN } |
InformeBathy { } |
InformeDEFromProttfaPourTous { } |
InformeDESansOSPourTous { } |
InformeGeneNameForPerox { Selection } |
InformeMGU4302 { } |
InformeOrganismePourBSD { {Source {}} } |
InformeReferencePourBSD { } |
Lana { {Qui {}} {Quoi {}} } |
LanaBestHits { IouM {Qui {}} } |
LanaCommonTargets { {Ext {}} } |
LanaCreateBadNuctfa { IouM FromFile ToRep } |
LanaHits { IouM } |
LanaIgbmc { } |
LanaLaTotale { {Etape {}} } |
LanaLesEtapesPossibles { } |
LanaLocaliseBestHits { IouM {Qui {}} } |
LanaMerck { } |
LanaRep { } |
LanaShow { } |
LanaShowTarget { Selection } |
ll { } |
MacsimsSpliRetPourNaomi { {Compress {}} } |
MenageU133 { {StartPAB {}} } |
MobBinaryPath { } |
MobCheckPrograms { {GetWhat {}} } |
MobDir { } |
MobListOfCommand { {Qui {}} {Quoi {}} } |
MobListOfEnv { {Qui {}} {Quoi {}} } |
MobListOfFichierXml { } |
MobyleDeploy { } |
MontagePhoto { {Ordre {}} {DirImages {}} {DirImagettes {}} {LargeurImagette {}} {HauteurImagette {}} {GetWhat {}} } |
NomDuOldGI { GI } |
NormaliseBanqueBlast { Source {Destin {}} } |
OrganismePresent { {Qui {}} {Quoi {}} {RepBlast {}} } |
OrganismesPourGenomiqueComparative { } |
PatternSearchInGenome { } |
PCR { MatriceForward AmorceForward AmorceReverse {Nom {}} } |
Pfalciparum { } |
PhyloDistribution { {Qui {}} {Quoi {}} {GetWhat {}} } |
PositionSurMrnaHNR { } |
QfO { {Qui {}} {Quoi {}} } |
QfO_BlastbaseDir { } |
QfO_CreateBlastbase { } |
QfO_CreateProteomesWithOX { } |
QfO_Dir { } |
QfO_ProteomesDir { } |
QfO_Wup { } |
RecupereSc { } |
References { Qui } |
ReferencesBSD { } |
RejectScerFlo { } |
ReorganiseBSD { {Action {}} } |
SauvePuzzleFit { Texte dans Fichier } |
ScerFlo { } |
SequencageAlvi { } |
Seraphin37Orfs { } |
SetGeneNameForPerox { } |
ShowPC { Fichier } |
Tbrucei { } |
TbruceiChromosomes { } |
TbruceiNuc { } |
TesteDoublon { } |
TestPCRAlvi { } |
Tparva { } |
TssForESRARE { } |
TTLLrenomme { } |
Valerie { RS RD } |
ValiGNHNR { } |
VraiNom { Betise } |
WikiTable { {TexteOuFichier {}} {What {}} {Separateur {}} } |
XenoGreffe { {FichierAccessProbeset {}} } |
XenoGreffe22 { } |
YEAHbadThingsInAlignment { {FichierSource {}} } |
YEAHbilan { Qui {Quoi {}} } |
YEAHblast { {Banque {}} } |
YEAHbosse { } |
YEAHcorrigeOffsetEtSpaceEtTilde { {Fichier {}} } |
YEAHcreateGoodAlignment { {Fichier {}} } |
YEAHfind { {Qui {}} } |
YEAHmaquilleAlignmentOld { {FichierSource {}} {FichierMaquille {}} } |
YEAHmaquilleRsf { {FichierSource {}} {FichierMaquille {}} } |
YEAHmouvement { } |
YeahNon { X } |
YEAHOrganisms { {A {}} {B {}} {C {}} } |
YEAHorganOf { Qui } |
YeahOui { X } |
YEAHpa { Qui {Quoi {}} {Val {}} } |
YEAHrecap { {Config {}} } |
YEAHreciprocal { } |
YEAHreduitYEAHpa { } |
YEAHshow { } |
YEAHshowAvecRef { LeDazi } |
YEAHshowAvecRefYeastProttfaBlastp { LeDazi } |
YEAHshowBlastAvecRef { Qui } |
YEAHshowIt { Qui Quoi } |
YEAHshowList { Selection {Liste {}} } |
YEAHshowSc { {Sc {}} {What {}} } |
YEAHshowYeast { {Selection {}} {Action {}} {What {}} } |
YEAHStore { {Qui {}} {Start {}} {Stop {}} } |
YeastGlossary { {Qui {}} {Quoi {}} } |
YesScNoEh { {Un {}} } |
YesScNoPf { {Un {}} } |
YesScNoTb { {Un {}} } |
| Procedure Detail |
proc AccessHNR { }
proc ALaMain { Quoi }
proc AlviCreePpcrProt { }
proc AlviVerif { }
proc BalibaseCorrectLink { }
proc BalibaseCreateBlastDatabase { }
proc Bathy2010 { {Action {}} }
proc BathyCompositionContig { {Qui {}} {Quoi {}} }
proc BestHitReciproc { Nom {BlastDir {}} {CutPN {}} {HitOnly {}} }
proc BestHitReciprocPourTous { {BlastDir {}} {CutPN {}} {HitOnly {}} }
proc BestInformePourBathy { }
proc BlastYEAH { {Start {}} {Stop {}} }
proc CanvaPuzz { }
proc ClonePuzzleFit { {OrgaCible {}} {PrefixeCible {}} {Destin {}} }
proc CorrigeHistolica { }
proc CorrigeInfosU33p2 { }
proc CorrigeMGU { }
proc CorrigeSynMito { }
proc CorrigeU133 { {Rep {}} }
proc CreateGscopeProjectGAL4 { }
proc CreateOligosAndPpcrForAlvi { }
proc CreateTfasForYEAH { Qui }
proc CreeLesSynthetases { Fichier Destination {AA {}} {AAOrig {}} }
proc CreeProtTfaPhorDeGenEmbl { }
proc DecortiqueBlastYEAH { {Start {}} {Stop {}} {Attendre {}} }
proc DeDoubleYEAHpa { }
proc DispatchCluspack { }
proc DoubleFof { }
proc ExchangeColumns { FilIn {FilOut {}} }
proc GenomiqueComparativeParBlast { {RepBlast {}} }
proc GetQS { Fichier }
proc GoodAccessForHam { }
proc InfHomolog { {Qui {}} {Quoi {}} {Ou {}} }
proc InformeAliasWithACIfNotGNPourTous { MauvaisAlias MauvaisGN }
proc InformeBathy { }
proc InformeDEFromProttfaPourTous { }
proc InformeDESansOSPourTous { }
proc InformeGeneNameForPerox { Selection }
proc InformeMGU4302 { }
proc InformeOrganismePourBSD { {Source {}} }
proc InformeReferencePourBSD { }
proc Lana { {Qui {}} {Quoi {}} }
proc LanaBestHits { IouM {Qui {}} }
proc LanaCommonTargets { {Ext {}} }
proc LanaCreateBadNuctfa { IouM FromFile ToRep }
proc LanaHits { IouM }
proc LanaIgbmc { }
proc LanaLaTotale { {Etape {}} }
proc LanaLesEtapesPossibles { }
proc LanaLocaliseBestHits { IouM {Qui {}} }
proc LanaMerck { }
proc LanaRep { }
proc LanaShow { }
proc LanaShowTarget { Selection }
proc ll { }
proc MacsimsSpliRetPourNaomi { {Compress {}} }
proc MenageU133 { {StartPAB {}} }
proc MobBinaryPath { }
proc MobCheckPrograms { {GetWhat {}} }
proc MobDir { }
proc MobListOfCommand { {Qui {}} {Quoi {}} }
proc MobListOfEnv { {Qui {}} {Quoi {}} }
proc MobListOfFichierXml { }
proc MobyleDeploy { }
proc MontagePhoto { {Ordre {}} {DirImages {}} {DirImagettes {}} {LargeurImagette {}} {HauteurImagette {}} {GetWhat {}} }
proc NomDuOldGI { GI }
proc NormaliseBanqueBlast { Source {Destin {}} }
proc OrganismePresent { {Qui {}} {Quoi {}} {RepBlast {}} }
proc OrganismesPourGenomiqueComparative { }
proc PatternSearchInGenome { }
proc PCR { MatriceForward AmorceForward AmorceReverse {Nom {}} }
proc Pfalciparum { }
proc PhyloDistribution { {Qui {}} {Quoi {}} {GetWhat {}} }
proc PositionSurMrnaHNR { }
proc QfO { {Qui {}} {Quoi {}} }
proc QfO_BlastbaseDir { }
proc QfO_CreateBlastbase { }
proc QfO_CreateProteomesWithOX { }
proc QfO_Dir { }
proc QfO_ProteomesDir { }
proc QfO_Wup { }
proc RecupereSc { }
proc References { Qui }
proc ReferencesBSD { }
proc RejectScerFlo { }
proc ReorganiseBSD { {Action {}} }
proc SauvePuzzleFit { Texte dans Fichier }
proc ScerFlo { }
proc SequencageAlvi { }
proc Seraphin37Orfs { }
proc SetGeneNameForPerox { }
proc ShowPC { Fichier }
proc Tbrucei { }
proc TbruceiChromosomes { }
proc TbruceiNuc { }
proc TesteDoublon { }
proc TestPCRAlvi { }
proc Tparva { }
proc TssForESRARE { }
proc TTLLrenomme { }
proc Valerie { RS RD }
proc ValiGNHNR { }
proc VraiNom { Betise }
proc WikiTable { {TexteOuFichier {}} {What {}} {Separateur {}} }
proc XenoGreffe { {FichierAccessProbeset {}} }
proc XenoGreffe22 { }
proc YEAHbadThingsInAlignment { {FichierSource {}} }
proc YEAHbilan { Qui {Quoi {}} }
proc YEAHblast { {Banque {}} }
proc YEAHbosse { }
proc YEAHcorrigeOffsetEtSpaceEtTilde { {Fichier {}} }
proc YEAHcreateGoodAlignment { {Fichier {}} }
proc YEAHfind { {Qui {}} }
proc YEAHmaquilleAlignmentOld { {FichierSource {}} {FichierMaquille {}} }
proc YEAHmaquilleRsf { {FichierSource {}} {FichierMaquille {}} }
proc YEAHmouvement { }
proc YeahNon { X }
proc YEAHOrganisms { {A {}} {B {}} {C {}} }
proc YEAHorganOf { Qui }
proc YeahOui { X }
proc YEAHpa { Qui {Quoi {}} {Val {}} }
proc YEAHrecap { {Config {}} }
proc YEAHreciprocal { }
proc YEAHreduitYEAHpa { }
proc YEAHshow { }
proc YEAHshowAvecRef { LeDazi }
proc YEAHshowAvecRefYeastProttfaBlastp { LeDazi }
proc YEAHshowBlastAvecRef { Qui }
proc YEAHshowIt { Qui Quoi }
proc YEAHshowList { Selection {Liste {}} }
proc YEAHshowSc { {Sc {}} {What {}} }
proc YEAHshowYeast { {Selection {}} {Action {}} {What {}} }
proc YEAHStore { {Qui {}} {Start {}} {Stop {}} }
proc YeastGlossary { {Qui {}} {Quoi {}} }
proc YesScNoEh { {Un {}} }
proc YesScNoPf { {Un {}} }
proc YesScNoTb { {Un {}} }